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五ヶ瀬川水系、日向灘に生息する生物140種800匹の生態を観察出来る。中でも宮崎県では捕獲が禁止された幻の魚と言われる「アカメ」を眼の前で観察することが出来る。また館内は明るくフラッシュ撮影はOK。小さい子供連れのファミリーには最適の水族館である。

雄大で清清しい景観を持ち、高千穂観光の表玄関として重要な名所である高千穂峡に、「玉垂れの滝の清らかな湧水を利用して、ヤマメ・ドンコ等の五ヶ瀬川水系に棲息する淡水魚を中心に、チョウザメ・オヤニラミ・ニッポンバラタンゴ・アカメや、ブラジル・アフリカに棲息する熱帯魚等約100種類を集めた淡水魚水族館です。